¿Cómo generar videoanimaciones de la evolución de sistemas de
Ecuaciones en Derivadas Parciales con la herramienta PDETOOL de MatLab?
Nada más fácil:

1) Desde PDETOOL: Menú Plot/Export movie...
2) Asignar un nombre de variable o aceptar el que
viene por defecto ("M")
3) Desde la línea de comando de Matlab, escribir la
sentencia siguiente:
>> movie2avi(M,'C:/Nombre del vídeo')

¡Hecho!